Nguyên lý của máy bơm siêu nhỏ có thể được chia thành một số phần chính để mô tả rõ ràng, sau đây là lời giải thích chi tiết về nguyên lý của nó:
Nguyên lý tự mồi:
Máy bơm siêu nhỏ có thể hút nước mà không cần chuyển hướng, nghĩa là nó có chức năng tự mồi.
Khi ống bơm của máy bơm là không khí, áp suất âm (chân không) hình thành khi máy bơm hoạt động được sử dụng và áp suất nước bên dưới cổng bơm được đưa lên dưới tác động của áp suất khí quyển, sau đó được xả ra từ đầu thoát nước của máy bơm.
Điều đáng chú ý là mặc dù một số máy bơm siêu nhỏ cũng có khả năng tự mồi, nhưng chiều cao tự mồi tối đa của chúng chỉ có thể đề cập đến chiều cao của nước có thể được nâng lên "sau khi thêm nước", chứ không phải là ý nghĩa thực sự của khả năng tự mồi.